很久很久以前，一颗神奇的黑磁石落在夸克星球上，由于黑磁石拥有极其庞大的能量与不可思议的魔法能力，让原本好爱和平心地善良的夸克族人，分裂成两派族群，互相争夺这颗灵石，最后一方获得大举胜利并一举占领整个星球，为防止继续壮大而…

故事从传说中的夸克族与暗黑族开始延伸。善良与邪恶形成两势力对抗，加入萌学园里的萌骑士团结在一起保护结界。萌学园里的魔法预言书蕴藏着什麼天大的秘密？奈亚公主及忧伤艾瑞克纯纯的情愫正在发酵，误闯萌学园的坚尼，会为萌骑士团带来…