拥有28万人口的三门市，其境内某天突然打开了一扇通往未知世界的大门。从大门的另一端，被称为“近界民”的怪物蜂拥而出。人类惊慌失措之余发现，地球现有的武器对近界民完全没有任何效果。危急时刻，神秘团体境界防卫组织“BORDER”出…

天野景太是一位普普通通的小学五年级学生。他在某个夏天去大森山捕虫时，通过扭蛋结识了妖怪执事维斯帕，并从维斯帕手中获得了妖怪手表。而他可以透过手表看见平常生活中看不见的妖怪们。